Citer comme: Havemann, Jo, Bezuidenhout, Louise, Achampong, Joyce, Akligoh, Harry, Ayodele, Obasegun, Hussein, Shaukatali,… Wenzelmann, Victoria. (2020). Exploiter l'infrastructure de la science ouverte pour une réponse africaine efficace à COVID-19 [préimpression]. doi.org/10.5281/zenodo.3733768


Auteurs

Équipe de base:

  • Jo Havemann, 0000-0002-6157-1494, Access 2 Perspectives & AfricArXiv, Allemagne
  • Louise Bezuidenhout, 0000-0003-4328-3963, Oxford University, AfricArXiv & Access 2 Perspectives, Afrique du Sud et Royaume-Uni

Correspondance: (JH & LB) info@africarxiv.org

Auteurs collaborateurs (par ordre alphabétique):


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Introduction

Le paysage de l'édition internationale subit actuellement un changement radical vers des pratiques de science ouverte et les activités de recherche liées à COVID-19 sont toutes rendues ouvertement accessibles pour un effort rapide de recherche et d'évaluation mené par la communauté (Akligoh et al.2020; projet JOGL COVID19, lettre ouverte: Contact Tracking et NHSX). Dans un article d'opinion pour Financial Times, le Premier ministre éthiopien et lauréat du prix Nobel de la paix 2019 Abiy Ahmed a mis en lumière l'importance des efforts mondiaux concertés pour lutter contre la pandémie en résumant: «[Si] le virus n'est pas vaincu en Afrique, il seulement rebondir sur le reste du monde ». Les dimensions économiques et politiques sur lesquelles Ahmed se concentre doivent être fondées sur une recherche scientifique solide - unique au niveau local, tout en étant connectée au niveau mondial. L'ouverture de la recherche dans les économies développées ne sera donc pas suffisante, il faut en outre soutenir, valoriser et relier les poches d'expertise existantes en Open Science sur le continent africain.

Avec la pandémie actuelle de coronavirus, le besoin urgent d'un accès ouvert aux résultats de la recherche augmentera les connaissances scientifiques du domaine public dans la littérature liée au COVID-19, permettant ainsi aux chercheurs africains de développer des solutions centrées sur l'Afrique pour lutter contre le virus du SRAS-CoV 2, tout en renforcer les ressources biomédicales locales des pays africains et accroître leur préparation aux futures flambées. Cela s'applique aux niveaux mondial et régional. Les précédentes épidémies de virus, telles que les récentes épidémies d'Ebola et de Zika en Afrique de l'Ouest, ont mis en évidence les effets dévastateurs d'un accès restreint aux données et de voies de diffusion mal coordonnées. Ce n'est qu'en supprimant les murs de paiement, en augmentant l'accès numérique aux ressources et en encourageant les pratiques de partage individuelles que les tentatives coordonnées pour atténuer les effets du virus peuvent réussir. Cela est vrai non seulement pour les réponses à court terme à la crise sanitaire, mais aussi pour les effets à plus long terme sur les économies africaines, les installations sociales et les moyens de subsistance des populations à travers le continent.

Les parties prenantes des pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI) ont ouvert la voie avec l'Open Access - en particulier le réseau brésilien de bases de données de revues en texte intégral consultable SciELO (Scientific Electronic Library Online), également représenté en Afrique du Sud. Nous encourageons les parties prenantes africaines à mettre en avant les poches d'expertise existantes. Il est important de reconnaître qu'une réponse coordonnée au partage d'informations en Afrique peut s'appuyer sur un large éventail de structures existantes soutenant l'ouverture dans la recherche et le partage d'informations. En effet, ce qui est nécessaire est d'attirer l'attention sur ces ressources existantes, de faciliter les connexions et la communication, et de combler les lacunes et les lacunes que cette cartographie expose.

Pour être plus efficaces, les acteurs africains de la recherche et de l'innovation doivent travailler le long de structures et de plates-formes existantes et abordables pour garantir que les données produites pendant cette pandémie répondent aux normes de données FAIR et que toutes les analyses qui en résultent sont publiées sur des plates-formes en libre accès et des données brutes sous-jacentes mises à disposition référentiels de données ouverts.

L'instauration de telles pratiques sera bénéfique non seulement pour la recherche COVID-19, mais pour la recherche africaine dans son ensemble, et établira de nouveaux flux de travail ouverts et collaboratifs ainsi que des mécanismes de publication. L'amélioration de l'ouverture au sein de l'érudition africaine est une priorité existante sur le continent, et un certain nombre de déclarations clés existent pour soutenir les efforts. Il s'agit notamment de la Déclaration de Dakar sur la publication en libre accès en Afrique et dans le Sud (2016) et des principes africains plus récents pour la communication savante en libre accès (2019). Ces lignes directrices définissent une vision de la recherche ouverte en Afrique qui répond aux priorités suivantes:

  • Fédérer les écosystèmes savants du continent d'Afrique du Nord, centrale, orientale, occidentale et australe et les connecter à l'écosystème mondial de la recherche.
  • Faciliter l'amélioration des barrières linguistiques, en particulier les langues régionales et traditionnelles africaines / francophones / anglophones / arabes.
  • Établir des espaces de travail et des ensembles d'outils technologiques adaptés à une utilisation dans des contextes de recherche africains pour faciliter une collaboration plus rapide et l'égalité des chances dans l'accès aux données et aux services indépendamment de l'emplacement, de la langue et d'autres conditions.
  • Interconnectez-vous avec d'autres initiatives, sources et projets pertinents à l'intérieur et à l'extérieur de l'Afrique à la fois entrants et sortants pour maximiser l'ouverture et l'échange d'informations de manière transparente.

L'opportunité que la pandémie offre à la recherche ainsi qu'aux communautés d'action telles que les fabricants, les (bio) hackers et les gouvernements est de réfléchir sur les changements systémiques qui sont apparus avant Corona, et que nous avons maintenant une réelle chance d'aborder collectivement.

Une approche africaine de la pandémie de COVID-19

Il est impératif d'adopter une approche holistique du renforcement des capacités institutionnelles au sein des centres de recherche et d'enseignement supérieur du continent. Tout comme la réalisation des objectifs de développement durable (ODD), la réponse à la crise de Covid-19 devra être apportée par une action collective. La réponse internationale à ce jour est centrée sur la capacité de se connecter à la population grâce aux médias et à la technologie, dont une grande partie est concentrée dans les métropoles de la plupart des pays africains. Le bilan de la vie humaine et des économies africaines requiert une réponse commune à l'échelle mondiale sur la meilleure façon d'utiliser et d'exploiter les ressources pour soutenir les pays les plus durement touchés par les réalités spécifiques et diverses de la vie quotidienne, en particulier. dans les zones urbaines (Adegbeye, 2020).

Réunir les principaux groupes d'intervenants et communautés, tels que:

  • Initiatives en matière de communication et de culture scientifique (scientifiques et journalistes en relations publiques)
  • Recherche (biomédicale & socio-économique)
  • Pôles technologiques et d'innovation (AfriLabs, i4Policy, ASKnet, ea)
  • Décideurs (niveaux municipal, national, régional)

Le 18 mars, AfricArXiv a lancé un effort de crowdsourcing décentralisé pour les ressources autour de COVID-19 dans un contexte panafricain. Le 26 mars 2020, l'Académie africaine des sciences (AAS) a organisé un webinaire pour des experts africains et non africains afin de lancer une réflexion commune en vue de définir un programme de recherche pour l'épidémie de COVID19 et de fournir un effort scientifique concerté pour lutter contre cette pandémie en Afrique. Les deux initiatives conviennent que l'approche doit inclure le service et la protection de tous les Africains, c'est-à-dire également des groupes vulnérables et marginalisés tels que les orphelins, les déplacés internes et les réfugiés. Une approche théorique de l'innovation inclusive a été décrite par McPhee et al. (2018) de l'approche traditionnelle de l'inclusivité et soyez sûr que nous considérons l'Afrique dans sa contemporanéité.

Connaissances autochtones et traditionnelles

Dans la plupart des pays africains, l'utilisation des médicaments traditionnels est courante parmi les communautés. Les médicaments traditionnels sont souvent utilisés en conjonction ou en remplacement des médicaments allopathiques. Les réponses coordonnées de COVID-19 en Afrique dépendent donc des praticiens de la santé traditionnels, des praticiens de la santé allopathique et des directives gouvernementales fournissant un message cohérent. En particulier, des conseils pour les guérisseurs traditionnels doivent être associés aux discussions COVID-19 sur les réponses nationales COVID-19.

La recherche sur les médecines traditionnelles et les systèmes de connaissances autochtones est en augmentation dans de nombreuses institutions africaines, et ces chercheurs experts peuvent servir de relais précieux entre les praticiens de la santé traditionnels, les gouvernements et les systèmes de santé nationaux (REF).

Dans un certain nombre de pays africains, la collaboration entre les communautés de prestataires de soins de santé est déjà en train d'émerger. Par exemple, les praticiens de la santé traditionnels (THP) en Afrique du Sud offrent une position coordonnée sur le COVID-19 et découragent les allégations fausses et trompeuses sur les pouvoirs de guérir ou de savoir comment guérir ou traiter le coronavirus (Covid-19). Des exemples de telles pratiques devraient être largement partagés pour information et meilleures pratiques.

Il est également important que la protection durement acquise des savoirs autochtones (comme en témoignent les principes de CARE) ne soit pas annulée par l'urgence de la réponse COVID-19. En particulier, la recherche dans des domaines tangentiellement liés à COVID-19, la santé et le bien-être doivent continuer à être protégés. Par exemple, les projets visant à promouvoir la production et l'utilisation durables de légumes indigènes africains pour la sécurité nutritionnelle et la réduction de la pauvreté (Abukutsa-Onyango, 2019). Les chercheurs africains sont bien placés pour examiner en permanence la recherche dans ces domaines afin de préserver la protection des données, l'éthique et la réutilisation respectueuse des connaissances traditionnelles et indépendantes.

Il est important de noter que ces domaines nécessitent un examen minutieux au sein et entre les communautés de recherche africaines et internationales et les organisations de défense (par exemple, le Comité de coordination des peuples autochtones d'Afrique, IPACC) à tous les niveaux. De nombreuses unités de recherche internationales ont des collaborations de longue date avec les communautés africaines, et de tels contacts peuvent également être mis à profit pour se connecter dans tous les domaines afin de faciliter une discussion et une collaboration optimales, garantissant la mise en œuvre des principes de CARE, le respect des Déclaration des Nations Unies sur les droits des peuples autochtones (UNDRIP) ainsi que sur les «questions de propriété intellectuelle dans le patrimoine culturel» (projet IPinCH).

Collaboration internationale

Une autre priorité de la gouvernance scientifique et des bailleurs de fonds est de soutenir la collaboration Sud-Sud. Ces collaborations peuvent faciliter le partage des meilleures pratiques et l'apprentissage mutuel afin d'identifier les voies et modes de fonctionnement réalisables à travers l'Afrique, et grâce à l'échange de connaissances et d'expertise entre l'Afrique, l'Amérique latine et l'Asie du Sud-Est. Il existe déjà de bons exemples de transfert de pratique réussi, comme l'adaptation de l'organisation d'édition latino-américaine Open Access SciELO pour l'Afrique du Sud.

Les bailleurs de fonds ont également apporté un soutien considérable aux projets et réseaux dirigés par des Africains qui renforcent les capacités de recherche. De tels exemples incluent la Plateforme Africaine de Science Ouverte (financée par le National Research Council of South Africa) et l'Alliance for Accelerating Excellence in Science in Africa (AESA - partenariat de l'Académie Africaine des Sciences (AAS), New Partnership for Africa's Development (NEPAD) Agence dotée d'un financement initial de 5.5 millions de dollars de la Fondation Bill & Melinda Gates, du Wellcome Trust et du Département britannique pour le développement international (DFID). Ces bailleurs de fonds fournissent d'importantes sources non seulement de fonds pour le développement futur des infrastructures, mais aussi d'expertise et de contacts avec l'expertise internationale et les acteurs de la gouvernance nationale / régionale.

Un éventail d'autres parties prenantes existent également au sein de l'écosystème de recherche africain qui travaillent déjà pour faciliter l'ouverture. S'ils sont correctement connectés, il est possible que ces outils numériques et ces parties prenantes puissent déjà contribuer de manière significative à la réalisation des aspirations décrites dans les déclarations ci-dessus. Les réseaux et initiatives mondiaux tels que JOGL ou GIG ont acquis ces dernières années une expérience considérable dans la facilitation et la gestion de communautés de pratique mondiales au-delà de la fourniture de bases de données et de référentiels.

Néanmoins, pour que les collaborations Sud-Sud s'épanouissent, davantage d'efforts doivent être consentis pour faciliter les cultures d'ouverture, de partage et de collaboration régionale. Cela a été largement reconnu comme une priorité pour la recherche africaine (REF). Développer la confiance mutuelle entre les membres de la communauté de différents pays, langues et cultures en plus de développer les capacités techniques est l'un des défis les plus pressants pour la communauté mondiale des sciences ouvertes en ce moment. Toute approche doit prendre en compte la gestion communautaire, le développement de mesures d'intégration, ainsi que les moyens de connecter la communauté africaine de science ouverte à d'autres parties prenantes concernées. Des exemples de communautés existantes, telles que H3Africa et MalariaGen, ainsi que les programmes DELTAS émergents fourniront des ressources utiles et des feuilles de route vers des pratiques de recherche collaborative.

Comme nous apprenons d'autres régions du monde qui ont environ deux semaines d'avance sur les temps d'incubation des coronavirus, les activités de recherche et d'innovation immédiates et directement liées doivent inclure une évaluation approfondie de l'évaluation du taux d'infection actuel et une analyse statistique des infections, des décès et de la récupération sur place. , aux niveaux national, régional et panafricain, ainsi qu'une enquête sur les impacts socio-économiques non seulement directement liés aux taux d'infection mais prenant en considération tous les niveaux de la société et les scénarios futurs.

Tableau 1: Les acteurs, leur expertise et leurs ressources

Retrouvez une liste croissante de plus de 120 parties prenantes sur info.africarxiv.org/stakeholders/.

Les intervenantsExpertise / responsabilitéInstitutions
Décideurs et agences de financementAssurer la viabilité financièreBAD, UA, chefs d'État, ministères de la recherche et de la santé, BAD, African UnionGates Foundation, CZI, Banque mondiale,
Établissements de santésoins médicauxcliniques, hôpitaux, guérisseurs traditionnels
Pôles d'innovation et makerspaces

Réparation, bricolage et upcycling de matériaux de rebut et d'équipements cassés, documentation ouverte du travail, connexion de la recherche et de l'action, création et utilisation de ressources éducatives ouvertes (REL) AfricaOSH, Open Science and Hardware Network - OSHNet (Tanzanie), AfriLabs, Impact Hub Network, Jokkolabs Network, RLabs Network, ainsi que plus de 400 pôles d'innovation individuels sur le continent africain tels que Vilsquare (Nigeria), MboaLab (Cameroun), KumasiHive (Ghana), STICLab (Tanzanie), Robotech Labs (Tanzanie) et bien d'autres
Les journalistes ;Assurer la culture scientifiqueRéseau africain d'alphabétisation scientifique
Scientifiques et chercheursCollecte de données, tests / écrans viraux, analyse de donnéesUniversités et instituts de recherche, NREN
Centres et plateformes éducativesRenforcement des capacités et formation sur tous les sujets pertinentsTCC Afrique, OER Afrique, INASP,…
Grand publicRechercher des informations auprès de sources fiables, distanciation sociale
Communautés et organisations internationales (mondiales)Connexion à des communautés de pratique mondiales, partage d'expériences et de meilleures pratiques, connexion à des sujets généraux, par exemple développement d'infrastructuresJust One Giant Lab (JOGL), Global Innovation Gathering (GIG), GOSH, ISOC; APC

La plupart, sinon la totalité, des parties prenantes se sont déjà préparées à une réponse COVID-19 réfléchie et dédiée. Il est important qu'au lieu d'agir en silos, nous coordonnions les stratégies et les approches entre les pays, les parties prenantes, les barrières linguistiques et les secteurs des sociétés.

Collaborer au développement de matériel pour les fournitures médicales

Le développement collaboratif de matériel à l'international a ses propres défis spécifiques. Ces directives sont conçues pour aider les nouvelles collaborations à éviter les pièges courants. Cette section est particulièrement destinée aux chercheurs du Grand Nord qui cherchent à aider à concevoir du matériel pouvant être construit et utilisé en Afrique

  1. Former des collaborations entre les fabricants, les professionnels de la santé et les utilisateurs finaux pour comprendre l'environnement dans lequel le matériel sera utilisé. Ceci est essentiel pour établir des spécifications appropriées. Les collaborateurs locaux auront probablement de l'expérience avec des appareils similaires et sauront dans quelle mesure ils fonctionnent dans l'environnement local. Tenez compte de la disponibilité de l'infrastructure de soutien (votre ventilateur nécessite-t-il une alimentation en oxygène fixe?), Tenez compte des conditions ambiantes (quelle est la plage de température de fonctionnement du matériel?) Ou de la fiabilité de l'alimentation électrique locale. Au cours des deux dernières années, le projet ouvert Horizon2020 Careables a acquis une grande expérience dans de telles collaborations entre différentes parties prenantes et propose une base de données des solutions existantes ainsi qu'un support pour la documentation.
  1. Former des collaborations pour la fabrication / réparation locale afin de mieux comprendre dans quelle mesure la conception peut être construite et réparée localement. La fabrication et la réparation locales sont essentielles pour améliorer la disponibilité et la disponibilité de tout matériel. Les pièces de rechange doivent être achetées ou produites localement pour que la fabrication et la réparation locales fonctionnent efficacement. Il convient de noter que les composants à faible coût / facilement disponibles en Europe ou en Amérique ne sont pas nécessairement en corrélation avec ce qui est à faible coût / facilement disponible localement. Pour cette raison, il est essentiel d'impliquer des collaborateurs locaux dès les premières étapes du prototypage.
  1. Tenez compte de la vitesse des chaînes d'approvisionnement internationales. Travaillez avec des collaborateurs locaux pour comprendre les délais d'achat d'équipements à l'international. La vitesse et la fiabilité des chaînes d'approvisionnement mondiales varient considérablement d'une région à l'autre. Ne présumez pas que parce qu'une pièce peut arriver d'une usine d'un autre continent à votre laboratoire en quelques jours, elle peut atteindre vos collaborateurs en même temps. Testez les chaînes d'approvisionnement dans la mesure du possible, même si une petite offre peut être envoyée directement entre les collaborateurs. La rareté ou le manque d'équipements de recherche peut être partiellement compensé en tirant parti du matériel Open Source, en réparant et en recyclant ce qui est disponible (Maia Chagas et al., 2019).
  1. Co-construire et tester en collaboration des prototypes. Bien que cela puisse sembler une duplication des efforts pour construire des prototypes simultanément dans plusieurs endroits, cela permet à tous les partenaires concernés d'être impliqués dans la conception. Il permet également d'identifier les problèmes d'identification précoce qui peuvent être rencontrés lors de la production locale. La vérification collaborative des prototypes, comme cela a été fait dans le cadre du projet JOGL Covid19, est un effort mondial utile pour soutenir la fabrication locale des conceptions qui se sont avérées les plus utiles dans différents contextes.

Le workflow de recherche dans un contexte africain

Dans la section suivante, nous décomposons le flux de travail de recherche général pour faire des suggestions spécifiques à chaque étape de la découverte, de l'analyse (y compris la planification de projet, la méthodologie, la génération de données, l'analyse des résultats), la rédaction et la publication.

Découvrabilité de la littérature de recherche pertinente

La plupart des éditeurs universitaires ont rendu la recherche pertinente sur COVID-19 accessible (temporairement!) En supprimant les frais d'abonnement.

Web of Science et Scopus ne représentent pas le résultat global de la recherche globale (Tennant et al., 2019). Malheureusement, les défis de conception en cours peuvent signifier que la littérature en anglais publiée dans des revues répertoriées dans des bases de données internationales (telles que DOAJ) est mise en avant-plan. Cela est particulièrement vrai pour les petites revues régionales africaines qui n'ont pas la capacité d'héberger leur contenu complet en ligne. Cela peut signifier que les résultats de la recherche africaine sont difficiles à trouver et à accéder.

Il est reconnu qu'un moyen clé pour compenser le manque de visibilité de la recherche africaine est de renforcer le rôle que les référentiels numériques jouent dans le paysage de la recherche africaine. À ce jour, la visibilité, l'interconnectivité et la possibilité de recherche de ces référentiels ont énormément varié. La cartographie du paysage du stockage et le traçage des interconnexions sont donc essentiels. Une contribution récente à cela a été la publication d'un ensemble de données dynamiques des référentiels de recherche numérique africains avec une carte visuelle interactive (Bezuidenhout, Havemann, Kitchen, De Mutiis et Owango, 2020). Ces ressources doivent être organisées et étendues pour fournir des informations à jour sur cet important réseau de partage de données.

Il est également important que l'écosystème émergeant du référentiel africain continue de collaborer avec des experts internationaux, tels que la communauté Re3data, pour s'assurer que leur conception et leur pratique respectent les normes internationales et facilitent l'interopérabilité. En plus de soutenir les référentiels, davantage d'efforts doivent être déployés pour renforcer les capacités de partage des données et d'accès ouvert au sein de la communauté de recherche africaine. Le soutien à la formation en littératie numérique est donc un élément essentiel d'un paysage de science ouverte en évolution. Une fiche technique des cours en ligne qui favorisent la culture numérique devrait être produite et organisée. Des efforts devraient être faits pour traduire le contenu dans des langues clés telles que l'anglais, le français, le swahili et l'arabe.

Outils numériques pour la science adaptés aux environnements à faibles ressources / Basé sur REF

Ces dernières années, il y a eu une expansion rapide des outils en ligne qui facilitent les différentes étapes du cycle de vie de la recherche. L'utilisation de ces outils en Afrique a toutefois été limitée. Il est probable que cela soit dû à un éventail de problèmes différents, notamment la sensibilisation, les traditions de recherche, la langue, les défis infrastructurels et les problèmes liés à la conception. Il est important que les chercheurs africains élaborent activement une liste d'outils numériques adaptés, préférés et durables.

Découverte: outils numériques pour la découverte d'œuvres savantes pertinentes.

1) = spécifique à l'Afrique, 2) = mondial, open source, 3) mondial, commercial


Recherche documentaire, RéférentielsGestion des références
1)Journaux africains en ligne (AJOL), AfricArXiv, DICAMES - - -
2) Ouvrir les cartes de connaissances, BASE SearchZotero, ReFigure
3)Google Scholar, The Lens, ScienceOpenSciLit, ResearchGate, Paperhive.orgMendeley

Méthodologie et analyse des données

Analyse: outils numériques pour l'analyse des travaux universitaires pertinents
1) = spécifique à l'Afrique, 2) = mondial, open source, 3) mondial, commercial


Notre MéthodologieRéférentiels de donnéesVisualisation de données
1)
openAfrica, Portail de l'autoroute de l'information en Afrique, Portail du programme de connaissances sur les infrastructures en AfriqueCode pour l'Afrique
2)Protocols.ioR-OpenSci, Re3Data, Dataverse, Oceanprotocol.com, OSF.ioGephiR
3)
FigshareKumu,

Collaboration à distance agile

Tous les travaux de connaissances collaboratifs bénéficient de l'utilisation d'une approche agile, qui offre l'avantage supplémentaire d'être relativement facile à pratiquer avec des équipes distantes également.

La source: https://www.leanovate.de/training/scrum/

À la base, le développement de produits agiles implique des processus de rétroaction fréquents et une action cyclique (itérative) à tous les niveaux: dans la pratique, au niveau de l'équipe et dans la gestion.

Les approches agiles apprécient que le développement de produits complexes ne peut pas être planifié à l'avance dans le détail, car les exigences changeront très probablement pendant la durée de vie du projet et ne sont souvent pas entièrement comprises au début du projet.

Au lieu de cela, l'approche agile alterne de courtes phases de planification et de développement. Les membres de l'équipe s'accordent sur les objectifs à atteindre au cours du sprint suivant, s'entretiennent brièvement quotidiennement et revoient les incréments à la fin de chaque sprint. Grâce à une rétrospective méthodologique, des connaissances supplémentaires sur les processus peuvent être acquises.

Les artefacts importants de toute collaboration agile sont: un arriéré partagé de tâches; un tableau des tâches partagé pour le sprint suivant; et des réunions régulières. Il est crucial pour les processus agiles qu'ils soient facilités par des rôles dédiés à deux niveaux, à savoir le produit (par exemple par un propriétaire de produit) et le niveau de processus (par exemple par un scrum master ou un coach agile).


Source ferméeOpen source
Planification / Tableau blanchttps://mural.co https://miro.com https://stormboard.com/https://openboard.ch https://wbo.openode.io/
Tableau de bordhttps://trello.com/ https://leankit.com/ https://wekan.github.io/ http://taskboard.matthewross.me/
Réunions / appels à distancehttps://zoom.us/ https://tico.chat https://jitsi.org/ https://unhangout.media.mit.edu/
Rétrospectivehttps://www.teamretro.com/ https://www.parabol.co/ https://retrorabbit.io/ https://github.com/funretro/distributed
Suite logiciellehttps://www.atlassian.com/software/jira https://www.openproject.org/ https://gitlab.com https://taiga.io/

En plus des ressources ci-dessus, le Coronavirus Tech Handbook est une ressource de crowdsourcing actuelle de plus de technologies pour le travail à distance. Il est important de noter que la collaboration à distance agile est une nouvelle forme d'organisation de la recherche pour de nombreux chercheurs dans les PRII et les PRI. Il serait avantageux pour les chercheurs africains qui ont de l'expérience dans ce format de fournir des études de cas et des exemples pour une discussion plus approfondie.

matériel

La conception et le développement collaboratifs de matériel constituent la méthodologie de base de la communauté mondiale des fabricants. Divers outils et bases de données existent et sont largement utilisés pour concevoir et examiner des conceptions en ligne, ce qui s'est déjà révélé bénéfique dans les réponses rapides à Covid19. Des milliers de fabricants du monde entier ont commencé à utiliser leurs imprimantes 3D et leurs découpeurs laser pour produire des écrans faciaux sous forme de dons aux hôpitaux et aux établissements de soins du monde entier, avec le soutien des fabricants des machines nécessaires:

Bases de données communautairesconception 3DElectronique / Conception de code
https://www.careables.org/ https://www.welder.app/ https://www.opensourceecology.org/ https://www.openhardware.io/ https://www.thingscon.org/ https://hackaday.io/ https://www.instructables.com/ https://makershare.com/ https://www.thingiverse.com/ https://grabcad.com/ https://www.prusaprinters.org/ https://fab365.net/ https://upverter.com/ https://easyeda.com/ https://library.io/ https://codebender.cc/

BIO bricolage et biotechnologie communautaire

Outre les défis liés à l'utilisation des outils de recherche numériques, les chercheurs africains doivent souvent faire face à des pénuries d'équipements de recherche physique. DIYBio et la biotechnologie communautaire offrent une approche ascendante croissante de la recherche qui tire parti de la science ouverte et des technologies ouvertes pour stimuler la recherche et le développement. Ce mouvement communautaire croissant est essentiel pour ouvrir les résultats de la recherche en provenance d'Afrique tout en permettant le développement de solutions durables. Les efforts de groupes de recherche comme l'Open Bioeconomy Lab et ses nœuds de laboratoire en Afrique, Hive Biolab, développent une trousse d'outils de recherche ouverte pour permettre aux laboratoires dans des environnements à ressources limitées et aux laboratoires en Afrique, en Asie et en Amérique latine de produire localement des réactifs de recherche comme des enzymes. qui ont la capacité de tester le virus du SRAS-CoV 2.

Gestion des données de recherche

La gestion des données COVID-19 est un sujet international et a vu de nombreuses organisations de données influentes, telles que la Research Data Alliance (RDA), former des groupes de travail pour définir les pratiques de gestion des données de recherche (RDM). Ces pratiques RDM tiennent compte des principes FAIR et CARE, mais il est vital que les membres africains de ces organisations internationales s'engagent dans ces discussions pour s'assurer que les normes et pratiques émergentes reflètent les données générées en Afrique.

La mobilisation de l'engagement des chercheurs africains dans les discussions sur la RDM fournira une opportunité plus large d'évaluer les pratiques actuelles de RDM, la formation et l'offre d'infrastructures sur le continent africain. Cela permettra l'évolution des pratiques de RDM qui s'alignent sur les pratiques internationales et reflètent les réalités de la recherche en Afrique. Il influencera également la conception des futures infrastructures de données et de publication. ?

Écriture et publication

1) = spécifique à l'Afrique, 2) = mondial, open source, 3) mondial, commercial


écriture collaborativeRéférentiels institutionnelsrevues (OA), plateformes de publication
1)
AfricArXiv, IAI / référentiels,
essa-africa.org/AERD, DICAMES
Recherche ouverte AAS, AJOL, https://upverter.com/ https://easyeda.com/ https://library.io/ https://codebender.cc/ Africain scientifique, Esprits africains
2)Auteur, Au verso, GitHubPréimpressions OSFPeerJDOAJ, scientificjournals.org/journal, Système de journal ouvert de PKP, Suite de produits de la Fondation Coko, Prix ​​de l'édition ouverte, Janeway / PubPub, ScholarLed, Répertoire des presses académiques
3)Google Docs
Qeios.com, Academjournals.org/

Processus de publication rapide (>>>)

Recherche et analyse Archivage Open Access du texte et des données Examen par les pairs de la communauté mondialePublication de revues
Sélection et collecte de la documentation et des données de recherche pertinentes,
recherche immédiate / aiguë sur les symptômes, les souches virales, l'impact sociétal et économique du verrouillage
https://github.com/dsfsi/covid19africa
AfricArXiv, DICAMES, bioRXiv, medArXiv, preprints.orgPRE-REVIEW
PeerCommunityIn
Hypothèse
AJOL, Le grenier de savoir, Revues cotées DOAJ

Plateformes de préimpression et d'accès ouvert axées sur l'Afrique comme le référentiel panafricain de préimpression AfricArXiv, basé au Kenya Recherche ouverte AAS plate-forme ainsi que des référentiels de préimpression orientés vers l'international, comme Open Science Framework (OSF), Preprints.org, biorXiv, medrXiv et ScienceOpen / preprints, mettant en œuvre un mécanisme d'examen par les pairs axé sur l'Afrique et pourtant internationalement connecté, par exemple en rejoignant une communauté internationale rapide des initiatives d'intervention comme Outbreak Science Rapid PREreview.

Il est important de reconnaître que les institutions africaines s'appuient principalement sur la publication d'articles évalués par des pairs pour évaluer l'excellence de la recherche et définir des critères de promotion. De tels systèmes d'évaluation sont en cours de discussion dans le monde, mais ne devraient pas changer dans un proche avenir. Ainsi, la nécessité pour les chercheurs africains de publier des articles évalués par des pairs dans des revues internationalement reconnues doit être respectée. Néanmoins, il est possible que l'utilisation de modèles de publication innovants, tels que la revue par les pairs, soit effectuée au niveau de la préimpression via des services tels que hypothèse et peercommunityin.org, peut rationaliser cette publication.

Sensibilisation, évaluation et transfert de connaissances

1) = spécifique à l'Afrique, 2) = mondial, open source, 3) mondial, commercial


Engagement du public et science citoyenneCommunautés et conseils techniques
1)Réseau mondial de laboratoires, Pollicy, Centre de communication scientifique Nigeria, Café scientifique, Réseau africain d'alphabétisation scientifique, sous le microscopeCode pour l'Afrique, AfricaOSH, Vilsquare, African Open Data, EthLagos.io, Open Science and Hardware Network (OSHNet), STICLab, Robotech Labs
2)ORCIDRassemblement pour le matériel Open Science (GOSH)

Un nombre restreint, mais croissant, d'initiatives et de réseaux de science citoyenne sur le continent offre également une voie de diffusion des connaissances. Leur implication peut être obtenue en mettant en place des projets collaboratifs, tels que l'information des citoyens dans plusieurs langues en partageant des messages traduits cohérents sur les réseaux sociaux (Bezuidenhout et al, 2020).

L'engagement du public et le journalisme scientifique est un domaine petit mais émergent en Afrique. Bien qu'il reste des défis associés à une faible culture scientifique et au manque historique d'engagement entre le monde universitaire et le public, de nombreux changements positifs récents ont été enregistrés. Il est essentiel que les chercheurs continuent de dialoguer avec le public pour éviter la désinformation et fournir des informations à jour sur la recherche locale et internationale. Pour cela, de nouvelles collaborations avec des journalistes africains pour améliorer l'accès du public à la recherche sont essentielles.

Atteindre tous les citoyens exige la restauration de la diversité linguistique via des approches journalistiques telles que traitées par l'African Science Literacy Network au Nigéria, par exemple via la messagerie vidéo et la diffusion d'informations clés fournies par l'OMS via les réseaux sociaux, comme suggéré par Bezuidenhout, McNaughton & Havemann ( 2020) ou des approches d'intelligence artificielle (IA) comme «Lavez-vous les mains» dans plus de 500 langues.

Améliorer la visibilité de la recherche africaine

L'interopérabilité est un élément clé de la communication scientifique et de recherche. Le flux d'informations doit être fiable pour construire une infrastructure de recherche et universitaire durable. Lier les travaux de recherche à différentes plates-formes de recherche académique définit l'interopérabilité et soutient la découvrabilité à travers les disciplines, les frontières et le temps.

Diverses organisations africaines sont déjà engagées dans ces questions. En particulier, les institutions de recherche / calcul intensif à forte intensité de données (comme DIRISA en Afrique du Sud) développent une expertise considérable en matière de partage de données et de plateformes de recherche interopérables. Ces institutions sont soutenues par un financement et une expertise nationaux et internationaux et représentent une ressource importante pour l'infrastructure émergente de la science ouverte en Afrique.

En outre, un certain nombre d'organisations indépendantes, telles que AfricArXiv et des référentiels similaires de pré-impression, contribuent également aux efforts visant à faciliter le partage d'informations entre les plates-formes. Avec le soutien des partenaires du réseau Africa Open Access, AfricArXiv fournit une ressource importante pour les chercheurs africains. À partir de l'authentification ORCID et de la permission de lire la contribution du chercheur à la distribution via d'autres plateformes et canaux selon Zenodo.

Renforcement des capacités et formation

Pour les chercheursPour le personnel médical
https://www.tcc-africa.org/ http://www.authoraid.info/ // https://www.inasp.info/ http://eifl.net/ https://www.jstor.org/https://science4africa.org/
Webinaire de formation médicale CDC Africa COVOD-19: https://vimeo.com/401111213/a4f2ac2720
AMREF, https://amref.org/

Le schéma de la propagation de la pandémie de COVID-19 qui a commencé en Chine, se déplaçant plus tard en Europe et aux États-Unis, a permis d'améliorer les tests de détection, et la montée de nombreuses initiatives de recherche COVID-19, ainsi que le temps le continent africain pour préparer sa réponse. Des chercheurs universitaires et du secteur privé dans des pays déjà largement touchés par la pandémie ont commencé à développer des composés qui empêchent le virus de se lier aux cellules humaines, à dépister une gamme de médicaments existants dans des essais cliniques et évaluent l'efficacité des anticorps collectés auprès de patients qui se sont rétablis. de l'infection à coronavirus, parmi de nombreuses autres tentatives.

Les collaborations internationales avec des scientifiques africains sur de telles entreprises sont inestimables dans les efforts visant à atténuer les dégâts de la pandémie sur le continent, à développer des solutions adaptées au contexte local (par exemple, des tests à faible coût / mobiles) et à enrichir de manière importante le travail des pairs dans Amérique du Nord / Europe en apportant des compétences, une expertise et une perspective distinctes au travail. Des organisations comme Science for Africa, qui initie et soutient des collaborations de recherche internationales, peuvent faciliter les efforts visant à renforcer rapidement les capacités de recherche COVID-19 sur le continent. En identifiant des groupes de recherche dans les pays africains ayant les compétences, l'expertise et la technologie pour mener ce type de recherche, ainsi que des homologues en Amérique du Nord et en Europe travaillant déjà sur des solutions, l'organisation peut s'associer - en fonction du type spécifique de recherche, des besoins de collaboration et expertise technique - et connectez des groupes de recherche à l'aide d'une plate-forme semi-automatisée

(Open) Ressources pédagogiques

Il existe déjà une longue histoire d'apprentissage à distance et en ligne en Afrique. Par exemple, l'Université d'Afrique du Sud, fondée en 1946, est l'une des plus anciennes et des plus grandes institutions d'enseignement à distance au monde. De plus, des centres tels que le Center for Innovation of Teaching and Learning de l'Université du Cap, offrent une expertise mondialement reconnue en matière d'apprentissage numérique. Des activités similaires sont organisées par des institutions et des plates-formes tant au niveau national qu'au niveau continental (https://oerafrica.org/). La cartographie de l'expertise existante dans ces domaines fournira des ressources précieuses pour l'expansion des REL en Afrique. En outre, la collecte de documents de conseil pour l'utilisation des REL / outils d'apprentissage numérique dans des environnements à faibles ressources (comme celui de l'UCT) fournira des ressources utiles.

Le rapport eLearning Africa 2019 répertorie 55 pays africains avec des exemples et des capacités pour les TIC pour l'éducation (profils de pays), dont beaucoup peuvent également être utilisés pendant le flux de travail de recherche, de l'élaboration du projet à la publication des résultats (Elletson et Stromeyer, 2019).

Durabilité financière

Optimiser les finances immédiates

Afin de faciliter l'évolution d'une infrastructure ouverte pour la réponse à COVID-19, il est essentiel que des fonds soient trouvés pour faciliter la coordination. Il existe de nombreuses façons de trouver ces fonds, notamment:

  • Consolider pour les activités qui se chevauchent
  • Identifier les projets en cours et les bailleurs de fonds actifs concernant la réforme des infrastructures (et former une base de données ouverte)
  • Organiser une liste d'appels de subventions ouverts à co-postuler
  • Contacter directement les bailleurs de fonds internes / nationaux et les gouvernements

Viabilité financière à long terme

La coordination des infrastructures ouvertes en Afrique bénéficiera à la recherche africaine bien au-delà de la pandémie de COVID-19. Il sera essentiel d'assurer la viabilité financière à long terme pour soutenir le maintien des structures émergeant de la crise actuelle et d'identifier de nouvelles parties prenantes pour accompagner l'évolution. Les problèmes à résoudre seront les suivants:

  • Recueillir des preuves sur la coordination induite par le COVID-19 et l'impact de ces infrastructures ouvertes
  • Continuer à faire pression pour un strict minimum de 1% du PIB pour la recherche des gouvernements nationaux et veiller à ce que l'augmentation constante des investissements dans les infrastructures de recherche soit au premier plan
  • Évaluer de manière critique les politiques nationales sur le partage des données et la recherche pour effectuer des changements qui soutiendront les infrastructures ouvertes
  • S'engager avec les conseils de financement pour s'assurer que les infrastructures des sciences ouvertes sont à leur ordre du jour
  • Appel à la collaboration internationale de la communauté mondiale des sciences ouvertes
  • Identifier des modèles de financement ou des modèles commerciaux viables qui fonctionnent pour et avec la communauté de recherche africaine. Nous proposons un modèle de financement transparent et mixte, comprenant:
  • panafricain: Union africaine, BAD,…
  • Gouvernements nationaux africains (ministères de R&E)
  • des sociétés de recherche nationales comme ASSAf (SA) et SRF (Soudan)
  • Des fondations africaines comme Mandela / Mo Ibrahim /…
  • Subventionné par un soutien international via la Fondation B&M Gates, l'Initiative Chan-Zuckerberg, la Fondation Mozilla, la Fondation Sloan, etc.
  • TU AS DIT; Agences de financement européennes: (UK) Wellcome Trust; (GER) DFG, Société Max Planck / Leibniz / Helmholtz, DAAD; (FR) CNRS; (SWE) SIDA
  • Services universitaires: traductions, communication scientifique au grand public (simplification de l'argot académique), formation au renforcement des capacités des scientifiques, des ECR et des étudiants // qui paie pour quel service?

Limites et défis

Les discussions sur le financement à long terme des infrastructures de la science ouverte doivent être spécifiques sur les bénéficiaires des résultats de la recherche partagés ouvertement au début du processus, et sur les formats qui facilitent cela correctement. Il est urgent de restructurer le système financier pour savoir qui paie quoi et quand. La littérature universitaire et les référentiels de données devraient faire partie intégrante du processus de recherche; mais qui paie les opérations / le traitement, l'allocation DOI, l'hébergement des données, etc. à quel niveau du processus?

Méfiez-vous des pays sanctionnés et de l'impact que cela pourrait avoir sur le paysage national de la recherche: Bezuidenhout et al (2019). Le manque de connectivité Internet fiable, abordable et rapide constitue toujours le plus grand défi à toute tentative de collaboration en ligne dans de nombreuses régions du continent africain.

Outlook

Nous appelons à l'établissement de partenariats et à la collaboration à travers le continent et avec le soutien international d'autres régions du monde et des pays donateurs.

Les références

Adegbeye OT, (2020). Pourquoi la distance sociale ne fonctionnera pas pour nous. Le correspondant (NG)

Principes africains pour la communication savante OA: info.africarxiv.org/african-oa-principles/

Plateforme Africaine de Science Ouverte - africanopenscience.org.za

Abukutsa-Onyango, Mary O. (2019). Expériences en recherche ouverte et éducation pour le développement durable en Afrique. Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.3582532

Ayebare R, Waitt P, Okello S et al. Tirer parti des investissements dans la préparation à Ebola pour COVID-19 en Afrique subsaharienne [version 1; examen par les pairs: en attente d'un examen par les pairs]. AAS Open Res 2020, 3: 3 (https://doi.org/10.12688/aasopenres.13052.1)

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Bezuidenhout, Louise, Havemann, Jo, Kitchen, Stephanie, De Mutiis, Anna et Owango, Joy. (2020). Référentiels africains de recherche numérique: cartographier le paysage [préimpression]. http://doi.org/10.5281/zenodo.3732274

Bezuidenhout L, Karrar O, Lezaun J, Nobes A (2019) Sanctions économiques et universitaires: impact négligé et conséquences à long terme. PLoS ONE 14 (10): e0222669. doi.org/10.1371/journal.pone.0222669

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Boudry C, Alvarez-Muñoz P, Arencibia-Jorge R, Ayena D, Brouwer NJ, Chaudhuri Z, Chawner B, Epee E, Erraïs K, Fotouhi A, Gharaibeh AM, Hassanein DH, Herwig-Carl MC, Howard K, Kaimbo Wa Kaimbo D, Laughrea P, Lopez FA, Machin-Mastromatteo JD, Malerbi FK, Ndiaye PA, Noor NA, Pacheco-Mendoza J, Papastefanou VP, Shah M, Shields CL, Wang YX, Yartsev V, Mouriaux F. 2019.Inégalité mondiale dans l'accès aux articles scientifiques en texte intégral: l'exemple de l'ophtalmologie. PeerJ 7: e7850 https://doi.org/10.7717/peerj.7850

Cárdenas, OVL (2019) Amorçage technosocial des futurs de Solarpunk pour / du Sud global. mutabit.com

Elletson, H. et Stromeyer, R. (eds) 2019. The eLearning Africa Report 2019, eLearning Africa / ICWE: Allemagne. Disponible depuis https://elearning-africa.com/media_publications_report_2019.php

Kramer, Bianca et Bosman, Jeroen. (2018, janvier). Arc-en-ciel des pratiques de science ouverte. Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.1147025

Maia Chagas, A .; Molloy, J .; Prieto Godino, L .; Baden, T. Tirer parti du matériel ouvert pour alléger le fardeau de COVID-19 sur les systèmes de santé mondiaux. Preprints 2020, 2020030362 doi: 10.20944 / preprints202003.0362.v1.

McPhee, C., Schillo, RS, Earl, L., et Kinder, J. 2018. Éditorial: Innovation inclusive dans les pays développés. Examen de la gestion de l'innovation technologique, 8 (2) 3-6. http://doi.org/10.22215/timreview/1134

Poynder, R (31 octobre 2019, The OA Interviews: K.Vijay Raghavan, conseiller scientifique principal, gouvernement de l'Inde. poynder.blogspot.com/2019/10/the-oa-interviews-k-vijayraghavan.html

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Smith I (2019). DOAJ Guest Post: Aperçu du paysage africain de l'OA avec un accent sur l'édition savante. Blog.doaj.org

Tennant, JP; Crane, H .; Crick, T .; Davila, J .; Enkhbayar, A .; Havemann, J .; Kramer, B .; Martin, R .; Masuzzo, P .; Nobes, A .; Rice, C .; Rivera-López, B .; Ross-Hellauer, T.; Sattler, S .; Thacker, PD; Vanholsbeeck, M. (2019) Dix sujets d'actualité autour de l'édition savante. Publications 2019, 7, 34. doi.org/10.3390/publications7020034

Annexe: Organisations et services numériques

Organisations africaines et non africaines et services numériques tels que mentionnés dans ce document. Pour une version étendue de ce tableau, allez à https://tinyurl.com/sfbb6xn

OrganisationurlPays
Programme de connaissance des infrastructures en Afriquehttp://infrastructureafrica.opendataforafrica.org/panafricain
Banque africaine de développement (BAD)https://www.afdb.org/enTunisie
Portail d'information africain sur l'autoroutehttp://dataportal.opendataforafrica.org/Panafricain
Journaux africains en ligne (AJOL)https://www.ajol.info/Afrique du Sud
Données ouvertes africaineshttps://africaopendata.net/Ghana
Réseau africain d'alphabétisation scientifiquehttps://www.africanscilit.org/Nigeria
AfriqueOSHhttp://africaosh.com/Ghana
AfricArXivhttp://info.africarxiv.org/panafricain
AfriLabshttps://www.afrilabs.com/Nigeria
Recherche BASEhttps://base-search.net/about/en/contact.phpGloba
bioRXivhttps://www.biorxiv.org/USA
Café scientifiquehttp://www.rouleauxfoundation.org/cafe-sci/Nigéria | Global
Careableshttps://www.careables.org/ UE | Global
Code pour l'Afriquehttps://github.com/CodeForAfrica/Kenya
Dataversehttps://dataverse.org/USA
DICAMEShttp://dicames.scienceafrique.org/Madagascar
EthLagoshttps://ethlagos.io/Nigeria
Figsharehttps://figshare.com/Londres | Etats-Unis
Gephihttps://gephi.org/Global
Rassemblement mondial sur l'innovation (GIG)https://www.globalinnovationgathering.org/Allemagne | Global
Réseau mondial de laboratoireshttps://glabghana.wordpress.com/Ghana
Google Scholarhttps://scholar.google.com/Global
Hypothèsehttps://hypothes.is/USA
Réseau Impact Hubhttps://impacthub.net/Autriche
INASPhttps://www.inasp.info/Royaume-Uni
Réseau Jokkolabshttps://www.jokkolabs.net/France
Juste un laboratoire géant (JOGL)https://jogl.ioFrance | Global
KumasiHivehttps://www.kumasihive.comGhana
Kumuhttp://kumu.io/USA
MboaLabhttps://www.mboalab.africaCameroun
medrXivhttps://www.medrxiv.org/Global
Mendeleyhttps://www.mendeley.com/Royaume-Uni
Oceanprotocol.comhttps://oceanprotocol.com/Singapour
OER Afriquehttps://www.oerafrica.org/Afrique du Sud
open Africahttps://africaopendata.org/Kenya
Ouvrir les cartes de connaissanceshttps://openknowledgemaps.org/Autriche
Réseau scientifique et matériel ouvert (OSHNet)http://www.oshnet.africaTanzanie
openAfricahttps://open.africa/Afrique du Sud
ORCIDhttp://orcid.org/USA
Cadre de science ouverte (OSF)http://OSF.ioUSA
Paperhivehttp://Paperhive.orgAllemagne
PeerCommunityInhttps://ecology.peercommunityin.org/France
Pollicyhttp://pollicy.orgpanafricain
Preprints.orghttps://www.preprints.org/Suisse
PRE-REVIEWhttps://www.prereview.org/USA
Protocols.iohttps://www.protocols.io/USA
rOpenScihttps://ropensci.org/USA
Re3Datahttps://www.re3data.org/Global
ReFigurerhttps://refigure.org/Global
ResearchGatehttps://www.researchgate.net/Allemagne
Réseau RLabshttps://rlabs.orgAfrique du Sud
Laboratoires Robotechhttp://www.robotech.co.tzTanzanie
Centre de communication scientifiquehttp://www.SciComNigeria.orgNigeria
ScienceOpenhttps://www.scienceopen.com/USA
SciLithttps://www.scilit.net/Suisse
STICLabhttp://www.sticlab.co.tzTanzanie
TCC Afriquehttps://www.tcc-africa.org/Kenya
L'objectifhttps://www.lens.org/Australie
Sous le microscopehttps://www.underthemicroscope.net/Kenya
Vilsquarehttps://vilsquare.org/Nigeria
Zoterohttp://zotero.org/USA


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